Можжевельник туркменский широко распространён в горах Копетдага, Большого Балхана, можно встретить в малом Балхане. Вне Туркменистана произрастает в Хоросане ( Иран). Произрастает в поясе 1000-2900 метров, на сухих каменистых склонах гор, глубоких ущелий. Редко, небольшими группами встречается на высотах 300-1000 метров. В ряде районах образует обширные редколесные леса, в особенности в районе хребта Миссенев, горы Тагарёва, Айдере, Сунчи, Нохура, вершинах хребта Большой Балхан. Средняя высота 3-8 метров, редко более 10 метров. Средняя плотность произрастания от 6 до 10 экземпляров на 1 ГА. Размножается семенным способом.
За последние столетия площади произрастания арчи резко сократились из-за вырубок человека. Она почти исчезла в Кюрендаге, очень мало её осталось в Восточном Копетдаге, Малом Балхане, в нижнем поясе Большого Балхана.
Можжевельник туркменский занесён в Красную книгу Туркменистана.
